县乡村振兴局设置4个内设机构。具体设置及主要职责分别是：

（一）综合科。负责文电、会务、机要、保密、党内法规、档案、政务信息、政务督办、党务等日常工作；负责对外协调、安全保障、后勤服务工作；组织拟订机关内部规章制度并监督实施；负责电子政务建设与管理；负责机关及所属事业单位的组织、人事、机构编制和财务工作；负责提出乡村振兴和促进全县经济社会发展的政策性建议；负责组织乡村振兴重大课题、发展战略的研究；指导、协调乡镇（街道）劳务经济发展和人力资源开发工作；组织开展乡村政策宣传和技能培训工作。办公地址：石柱土家族自治县万安街道万寿大道101号，1楼101室，联系电话：023-73378574；办公时间：周一至周五上午9∶00—12∶00，下午14∶30—18∶00（法定节假日除外）

（二）项目科。负责拟订年度和阶段性乡村振兴建设计划；负责乡村振兴项目库建设，承担乡村振兴资金、项目、物资综合管理工作；指导乡村振兴项目的实施；承担乡村振兴情况的信息统计、动态监测和绩效考评；组织实施全县乡村振兴产业发展规划；配合开展产业扶贫、科技扶贫工作；负责乡村振兴龙头企业的指导和服务工作；承担监督乡村振兴资金、项目管理制度的执行工作，组织协调有关部门对乡村振兴资金管理使用情况和乡村振兴项目建设情况进行监督检查。办公地址：石柱土家族自治县万安街道万寿大道101号，3楼304室，联系电话：023-73378595；办公时间：周一至周五上午9∶00—12∶00，下午14∶30—18∶00（法定节假日除外）

（三）社会扶贫科。负责协调社会各界的乡村振兴工作，承担联系中央国家机关定点防贫、市扶贫集团对本县的巩固拓展脱贫攻坚成果工作；承担组织、协调本县党政机关和民间力量等的巩固拓展脱贫攻坚工作；承办外资和外援乡村振兴项目的引进和实施工作；承担组织、协调和指导革命老区建设工作。办公地址：石柱土家族自治县万安街道万寿大道101号，3楼305室，联系电话：023-73378528；办公时间：周一至周五上午9∶00—12∶00，下午14∶30—18∶00（法定节假日除外）

（四）内部审计科。负责机关及所属事业单位的内部审计工作，承担乡村振兴资金审计的相关工作；受理涉及乡村振兴资金项目的群众举报工作。办公地址：石柱土家族自治县万安街道万寿大道101号，1楼102室，联系电话：023-73378201；办公时间：周一至周五上午9∶00—12∶00，下午14∶30—18∶00（法定节假日除外）

机关党支部。负责机关及直属单位党群工作。